Открываете студию, затем создаёте проект интеллектуальных устройств, конечную платформу выбираем Windows Mobile 6 Professional SDK, шаблон приложение для устройства. После этого, открывается знакомое многим окно конструктора, прямо как при создании WinForm приложений для ПК или при создании приложений для Windows Phone. Добавляйте любые элементы, прописывайте логику, в общем делайте всё что хотите

Вот сделали вы приложение своей мечты. Расставили контролы, прописали логику, но как же собрать это чудо чтобы показать друзьям или всему интернету? Легко. Сначала нужно убедиться, что приложение создано без ошибок. Нажмите либо на F5, либо на кнопку слева от Debug (плей короче). Появилось окно где развернуть приложение? Вы великолепны, и не допустили ни одной ошибки (по крайней мере компилятор их не заметил)! Выберите Windows Mobile 6 Professional Emulator, нажмите развернуть и ждите. Когда приложение откроется в эмуляторе, потыкайте его там и затем приступайте к следующему шагу.

Теперь нужно получить реальный экспиренс от тыкания вашего приложения, его необходимо развернуть на устройство. В зависимости от ОС, если у вас Windows XP/2000/2003, то установите ActiveSync 4.5. Если же у вас Windows Vista/7, то установите Windows Mobile Device Center. Затем откройте программу, убедитесь что КПК синхронизирован, затем опять же повторите действия из предыдущего спойлера но выберите Windows Mobile 6 Professional Device. Если всё получилось - приложение должно открыться на КПК. Иначе, хз, у меня вообще не получилось выполнить коннект к wmdc, так что тут я бессилен

Опишу максимально кратко: нажимаете ПКМ на проект, открыть папку в проводнике Windows, перейдите в bin, debug, и перекиньте exe файл на кпк, затем там его и запустите.